RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SSX8Q7RTT4 187 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf53Q8IXP5 236 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR4C16Q8NGL9 310 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR10G6Q8NH81 332 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FGFBP3Q8TAT2 258 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01587Q99440 93 aa2.46□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.46□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.46□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 USP54Q70EL1 1684 aa2.46□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF141Q15928 474 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM9BQ9NQ34 198 aa2.45□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 FIS1Q9Y3D6 152 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa2.45□□□□□ -2.02
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