RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPSQ8N2Z9 138 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF152Q8N8N0 203 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSC22D3Q99576 134 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5M8Q8NGP6 311 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOX15O60248 233 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 COMMD5Q9GZQ3 224 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNAPC5O75971 98 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA3P12429 323 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR1C2P52895 323 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASPHD1Q5U4P2 390 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR9G9P0C7N8 305 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf68Q2NKX9 166 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP57Q9NU63 452 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D24Q9ULP9 559 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QZ24 198 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1-5P01602 117 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM187Q14656 261 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM56Q96MV1 263 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 E7EUB6 86 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC6A1P30531 599 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASAH1Q13510 395 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM65Q6PI78 240 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A42Q86VD7 318 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF695Q8IW36 515 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 LHFPL5Q8TAF8 219 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRNDQ9UKY0 176 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSG2Q9Y328 171 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 APELAP0DMC3 54 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 PF4V1P10720 104 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYOD1P15172 320 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCNL1Q6ZST4 164 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 FKBP11Q9NYL4 201 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX22C9J3V5 150 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 P0C879 139 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2B8PP59922 312 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM268Q5VZI3 342 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MZT2BQ6NZ67 158 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL22RA2Q969J5 263 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK15Q9H2R5 256 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM14BQ9NUH8 114 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLVCR2Q9UPI3 526 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GW64 132 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf61A6NNL5 157 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAMP1P23763 118 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB9AP51151 201 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFITM3Q01628 133 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5T1Q8NG75 326 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4A16Q8NH70 328 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PRX2 142 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BUA1 57 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRPXP78539 464 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM219AQ8IW50 185 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYOZ3Q8TDC0 251 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMX3A6NHT5 357 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 CGB1A6NKQ9 187 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R1AQ13522 171 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1L8Q8NGR8 309 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5B3Q8NH48 314 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLA2Q9H6Q3 261 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51B2Q9Y5P1 312 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRBP04435 133 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC9CQ8N5M4 171 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASTOR1Q8WTX7 329 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf85Q9H1P6 137 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR13Q9NZ81 148 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNK1Q9H4A3 2382 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFT2D2O95562 160 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGI3Q8N145 548 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 DBX1A6NMT0 343 aa25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRI3O95415 125 aa25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF429Q86V71 674 aa25.8■■□□□ 1.72
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