RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568670.5

FANCI-215, Transcript of FA complementation group I, human

TSL 3

Gene FANCI, Length 285 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FANCI-215	ENST00000568670	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	C4BPB	P20851	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670		Q499Y3	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670		A0A0A6YYD4	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670		K7EMT4	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	CHEK1	O14757	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	SOCS1	O15524	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	KBTBD11	O94819	623 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	SRM	P19623	302 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	EMP1	P54849	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	THYN1	Q9P016	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FANCI-215	ENST00000568670	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	OGG1	O15527	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	YIF1A	O95070	293 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	LALBA	P00709	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64	4e-6	■■■■□ 23.6
FANCI-215	ENST00000568670	MAS1L	P35410	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	SERPINB10	P48595	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	ETV1	P50549	477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	UNC119	Q13432	240 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	POMP	Q9Y244	141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	FABP7	O15540	132 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	DFFB	O76075	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	UBB	P0CG47	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	SPP1	P10451	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	CALB2	P22676	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	DLK1	P80370	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FANCI-215	ENST00000568670	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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