RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 NAT1P18440 290 aa11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 RPL30P62888 115 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 CDK10Q15131 360 aa11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 HOGA1Q86XE5 327 aa11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.12□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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CMTM3-215ENST00000568477 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 C7orf66A4D0T2 115 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 MSGN1A6NI15 193 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 PRAF2O60831 178 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV2-14P01704 120 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 CD3DP04234 171 aa11.11□□□□□ -0.63
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CMTM3-215ENST00000568477 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 ACSM6Q6P461 480 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 MMD2Q8IY49 270 aa11.11□□□□□ -0.63
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CMTM3-215ENST00000568477 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 OR4C12Q96R67 309 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.11□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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CMTM3-215ENST00000568477 FCGR2CP31995 323 aa11.1□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF66Q6ZN08 573 aa11.1□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
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CMTM3-215ENST00000568477 USMG5Q96IX5 58 aa11.1□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 SPIN2AQ99865 258 aa11.1□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.1□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.1□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 CCNKO75909 580 aa11.09□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 IL5P05113 134 aa11.09□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 FCER2P06734 321 aa11.09□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF735P0CB33 412 aa11.09□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 KIR2DS2P43631 304 aa11.09□□□□□ -0.63
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CMTM3-215ENST00000568477 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.09□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.09□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.09□□□□□ -0.63
CMTM3-215ENST00000568477 TENM3Q9P273 2699 aa11.09□□□□□ -0.63
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CMTM3-215ENST00000568477 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 SNAPC3Q92966 411 aa11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 OR2A7Q96R45 310 aa11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.08□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.08□□□□□ -0.64
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CMTM3-215ENST00000568477 TNFSF12O43508 249 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 KBTBD11O94819 623 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 HRASP01112 189 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 TAS2R46P59540 309 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 FXYD4P59646 89 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 RHOGP84095 191 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 GPHA2Q96T91 129 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.07□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.06□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 IFNA6P05013 189 aa11.06□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 GP9P14770 177 aa11.06□□□□□ -0.64
CMTM3-215ENST00000568477 MAS1LP35410 378 aa11.06□□□□□ -0.64
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