RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560353.1

APH1B-208, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-208ENST00000560353 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 Q9N2K0 584 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 OR2T8A6NH00 312 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 CHEK1O14757 476 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 CD5P06127 495 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SRMP19623 302 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 HTR2CP28335 458 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 DEFB131AP59861 70 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ARFRP1Q13795 201 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ZNF503Q96F45 646 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 C5orf30Q96GV9 206 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ATG101Q9BSB4 218 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 LINC00473A8K010 186 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TRDCB7Z8K6 153 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 CYB5BO43169 146 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 KBTBD11O94819 623 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 REG1AP05451 166 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 UBBP0CG47 229 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 XGP55808 180 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 GNGT1P63211 74 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 PLA2G7Q13093 441 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 MLANAQ16655 118 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 Q499Y3 187 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ATP6V0BQ99437 205 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 AK3Q9UIJ7 227 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 C4BPBP20851 252 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 FLOT2Q14254 428 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 XAF1Q6GPH4 301 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SMIM19Q96E16 107 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SLC29A1Q99808 456 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 NACAE9PAV3 2078 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 A0A1W2PPK0 400 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 BET1O15155 118 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 OGG1O15527 345 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 FCGR3BO75015 233 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ATP6AP1Q15904 470 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SSX1Q16384 188 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 OR10K2Q6IF99 312 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TCF24Q7RTU0 167 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 GGHQ92820 318 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TM2D1Q9BX74 207 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 MDFICQ9P1T7 246 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 TMEM189A5PLL7 270 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 FABP7O15540 132 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 CD3GP09693 182 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 LIMS3P0CW19 117 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 LIMS4P0CW20 117 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 HTN3P15516 51 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 CELP19835 753 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 CRHBPP24387 322 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 LCE3BQ5TA77 95 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.27□□□□□ -1.25
APH1B-208ENST00000560353 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms