RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552433.1

LETMD1-233, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 2

Gene LETMD1, Length 727 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	POMP	Q9Y244	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	LAMB2	P55268	1798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433		H7BYZ3	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SULT2B1	O00204	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TIMM23	O14925	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	CD14	P08571	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	CCR2	P41597	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MTPN	P58546	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TAS2R46	P59540	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF92	Q03936	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	FRZB	Q92765	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	DPY30	Q9C005	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433		A0A087WWV3	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433		F6UB75	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433		J3QT63	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	BMPR1B	O00238	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	FGF17	O60258	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	NPIPB7	O75200	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	NDUFS7	O75251	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	TNFSF13	O75888	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	CXorf1	O96002	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	TNF	P01375	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433		P0DMU3	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	SPN	P16150	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	LPAR6	P43657	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	DAD1	P61803	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433		Q499Y3	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433		Q6ZRU5	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	PSMF1	Q92530	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	C7orf71	A4D174	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433		A8MT66	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433		B4DXG7	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	LMX1B	O60663	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LETMD1-233	ENST00000552433	OR10J1	P30954	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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