RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 RTTNQ86VV8 2226 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 C15orf61A6NNL5 157 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 CX3CL1P78423 397 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 GSX2Q9BZM3 304 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 CCSO14618 274 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 RAB24Q969Q5 203 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 LINC01619G3V211 115 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 UPK2O00526 184 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 IL4P05112 153 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM50BP56557 158 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 HTN3P15516 51 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 GPR183P32249 361 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 ASIPP42127 132 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TVP23CQ96ET8 276 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 M6PRP20645 277 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 CCL1P22362 96 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 SLAQ13239 276 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00303Q3SY05 128 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 FAM210BQ96KR6 192 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PSCAO43653 123 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 EGR1P18146 543 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TEX261Q6UWH6 196 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 FOXC2Q99958 501 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 HSBP1O75506 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 CFHR2P36980 270 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R1AQ13522 171 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF429Q86V71 674 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM18P0DKX4 95 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 INSL3P51460 131 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 FGFRL1Q8N441 504 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 NEU1Q99519 415 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 KIR2DL4Q99706 377 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 BET1LQ9NYM9 111 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 RAMP1O60894 148 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ARTNQ5T4W7 220 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM8Q96KF7 97 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.71□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 NABP1Q96AH0 204 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SPSB4Q96A44 273 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 KLK11Q9UBX7 282 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TTC28Q96AY4 2481 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 CBY3A6NI87 242 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM262E9PQX1 116 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS2P07478 247 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 CELA3BP08861 270 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SULT1A2P50226 295 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ASCL2Q99929 193 aa6.7□□□□□ -1.34
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