RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 WISP2O76076 250 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CLDN1O95832 211 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TGFAP01135 160 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TYMSP04818 313 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 UMODP07911 640 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 PSG2P11465 335 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 IRF2P14316 349 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 RAB4AP20338 218 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TUBG1P23258 451 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ANOS1P23352 680 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 PAX9P55771 341 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TAS2R60P59551 318 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 RANP62826 216 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TNFRSF9Q07011 255 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 GABRA6Q16445 453 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 HLA-BQ31612 363 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 COX19Q49B96 90 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 FRZBQ92765 325 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 LURAP1Q96LR2 239 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CSTL1Q9H114 145 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 GAB2Q9UQC2 676 aa3.59□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 A0A1W2PPV4 95 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 XKRY2A2RUG3 117 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 H3BP45 60 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 SLC31A2O15432 143 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TNFSF12O43508 249 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 NXPH2O95156 264 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TMEM50AO95807 157 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TOMM40O96008 361 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 SOD3P08294 240 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 PATE4P0C8F1 98 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 PGA5P0DJD9 388 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 IAPPP10997 89 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 ACP1P24666 158 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 IL2RGP31785 369 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 OTX2P32243 289 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 CEACAM6P40199 344 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 PDLIM4P50479 330 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 ERVK-16P61578 105 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 PPP1CBP62140 327 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 GNB2P62879 340 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 PAFAH1B2P68402 229 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TGFBR3Q03167 851 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 RAB31Q13636 194 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 SLC10A1Q14973 349 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 HERPUD1Q15011 391 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 ZNF146Q15072 292 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 TDHQ8IZJ6 230 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 FGFRL1Q8N441 504 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 OR4F5Q8NH21 305 aa3.58□□□□□ -1.84
USP25-210ENST00000549362 OR4X1Q8NH49 305 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms