RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF525	Q8N782	197 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TNFSF4	P23510	183 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	GAPT	Q8N292	157 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	HES4	Q9HCC6	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SIRPB1	O00241	398 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CLDN1	O95832	211 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CD55	P08174	381 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	EGR1	P18146	543 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PSMB3	P49720	205 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	RBKS	Q9H477	322 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	NAGK	Q9UJ70	344 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997		A1L4Q6	167 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SH2D1B	O14796	132 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	F2R	P25116	425 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	G0S2	P27469	103 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	OR3A1	P47881	315 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	LHX4	Q969G2	390 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TESK1	Q15569	626 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SYNGR2	O43760	224 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TFF1	P04155	84 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CFHR2	P36980	270 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SCGB1D1	O95968	90 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	HAND1	O96004	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	LHB	P01229	141 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TNFRSF1A	P19438	455 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997		Q8TCH9	128 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PARL	Q9H300	379 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	VSIR	Q9H7M9	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	FOXL1	Q12952	345 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ESD	P10768	282 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PPOX	P50336	477 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23

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