RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542570.5

TOP3A-208, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3A, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-208ENST00000542570 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.41□□□□□ -1.06
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TOP3A-208ENST00000542570 ZNF785A8K8V0 405 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM178BH3BS89 294 aa8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-208ENST00000542570 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.41□□□□□ -1.06
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TOP3A-208ENST00000542570 RPRMQ9NS64 109 aa8.4□□□□□ -1.06
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TOP3A-208ENST00000542570 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-208ENST00000542570 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.4□□□□□ -1.06
TOP3A-208ENST00000542570 MMP26Q9NRE1 261 aa8.4□□□□□ -1.06
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TOP3A-208ENST00000542570 TMEM218A2RU14 115 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 RGS13O14921 159 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TEPPQ6URK8 271 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CORO2AQ92828 525 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 MT-ND4LP03901 98 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 THBDP07204 575 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 OR9G9P0C7N8 305 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 PF4V1P10720 104 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TAS2R45P59539 299 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SPCS3P61009 180 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TFF3Q07654 80 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM219Q86XT9 240 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 GINS3Q9BRX5 216 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.39□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 MBP02144 154 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 IGKV1-16P04430 117 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.39□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 H0Y8G0 127 aa8.39□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 SOD3P08294 240 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 NAT1P18440 290 aa8.39□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 PPOXP50336 477 aa8.39□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.39□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 LINC00869P0C866 280 aa8.38□□□□□ -1.07
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TOP3A-208ENST00000542570 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 HTN1P15515 57 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ERVFC1-1P60608 527 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 FXYD3Q14802 87 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 RAB24Q969Q5 203 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 C11orf94C9JXX5 98 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 F6UZH7 168 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 RRHO14718 337 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 IGKV1-5P01602 117 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 BPIFB3P59826 476 aa8.38□□□□□ -1.07
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF345Q14585 488 aa8.38□□□□□ -1.07
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