RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 CHD6Q8TD26 2715 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GU03 582 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GWB2 263 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LYRM9A8MSI8 78 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 IQCF6A8MYZ5 107 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 H0Y980 276 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SMKR1H3BMG3 65 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 H7C417 338 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 J3QLI3 93 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 HCKP08631 526 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TBPP20226 339 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MPV17P39210 176 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 PAX9P55771 341 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 OR2T2Q6IF00 324 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 HOGA1Q86XE5 327 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CMBLQ96DG6 245 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SEH1LQ96EE3 360 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 DIABLOQ9NR28 239 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 DPRXA6NFQ7 191 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 E9PLD3 99 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZR03 302 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-13P01766 116 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP5-9P26371 169 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 PRSS3P35030 304 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GLRXP35754 106 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 VEGFCP49767 419 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF83P51522 516 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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