RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526774.5

TTC17-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, human

TSL 1 (best)

Gene TTC17, Length 3,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC17-208	ENST00000526774	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	HELT	A6NFD8	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	C9orf172	C9J069	976 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	SPRY3	O43610	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TIMP3	P35625	211 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	MLNR	O43193	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	FOXH1	O75593	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	MYOD1	P15172	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	GCHFR	P30047	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TNFSF10	P50591	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774		F2Z2F3	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	IRF2	P14316	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	IGFBP2	P18065	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	CDKN1A	P38936	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774		Q6ZR03	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	MGST2	Q99735	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	APC2	O95996	2303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ADH4	P08319	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	CAMP	P49913	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	ZNF83	P51522	516 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	EFNB3	Q15768	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	RND1	Q92730	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	DYSF	O75923	2080 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	MPDU1	O75352	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	CA2	P00918	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	SRI	P30626	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC17-208	ENST00000526774	FOXL1	Q12952	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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