RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523702.5

CPS1-211, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CPS1, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-211ENST00000523702 MED13Q9UHV7 2174 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 NBASA2RRP1 2371 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 LRRK2Q5S007 2527 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 A0A0G2JMP0 313 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 A0A1B0GV90 55 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 CCDC160A6NGH7 325 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 F5H5T6 163 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 FABP7O15540 132 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TTC4O95801 387 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 MT-CO2P00403 227 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TRBV12-3P01733 135 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 DLX6P56179 175 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TAS2R41P59536 307 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 PAFAH1B2P68402 229 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ST3GAL4Q11206 333 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TRAM1Q15629 374 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 KCTD16Q68DU8 428 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TCF24Q7RTU0 167 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 GRINAQ7Z429 371 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 LINC00301Q8NCQ3 95 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR4M2Q8NGB6 313 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR8J3Q8NGG0 315 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR2T29Q8NH02 315 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 CD200R1Q8TD46 325 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 Q8WTZ3 238 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TMEM234Q8WY98 164 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 KCNS1Q96KK3 526 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR4K3Q96R72 315 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 SERPINI1Q99574 410 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 UGT2B28Q9BY64 529 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 HS3ST2Q9Y278 367 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.12□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 M0QYV0 167 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 GPR31O00270 319 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TAAR5O14804 337 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 PHYHO14832 338 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 DLEU1O43261 78 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 S1PR2O95136 353 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 IGLV2-8P01709 118 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 IGHV3-11P01762 117 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 CCL4P13236 92 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 PAX6P26367 422 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 CLDN12P56749 244 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR10A3P58181 314 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 PMVKQ15126 192 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 LCE3AQ5TA76 89 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 FAM78BQ5VT40 261 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 HBMQ6B0K9 141 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 C22orf39Q6P5X5 142 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OPN5Q6U736 354 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 LRRC18Q8N456 261 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ASB17Q8WXJ9 295 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 OR5P2Q8WZ92 322 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 DOK1Q99704 481 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 COA4Q9NYJ1 87 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 FLNCQ14315 2725 aa3.11□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 A0A0D9SEW6 157 aa3.1□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.1□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ZNF878C9JN71 531 aa3.1□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 PDE6DO43924 150 aa3.1□□□□□ -1.91
CPS1-211ENST00000523702 PDYNP01213 254 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.4 ms