RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RAB8B	Q92930	207 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GALM	Q96C23	342 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	STARD4	Q96DR4	205 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SMIM10	Q96HG1	83 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GPR82	Q96P67	336 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	IMMP2L	Q96T52	175 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DPY30	Q9C005	99 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RDH14	Q9HBH5	336 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GALP	Q9UBC7	116 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	WDR45	Q9Y484	360 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	C5orf42	Q9H799	3197 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	COL4A6	Q14031	1691 aa		2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GTI1	187 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GW64	132 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ODAM	A1E959	279 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM213	A2RRL7	107 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057		A6NDN8	102 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TLCD2	A6NGC4	264 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057		A6NIN4	97 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF727	A8MUV8	499 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	XRCC2	O43543	280 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TBL1X	O60907	577 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ARL6IP5	O75915	188 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TIMP1	P01033	207 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	HLA-H	P01893	362 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GPX2	P18283	190 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CEL	P19835	753 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	S100A3	P33764	101 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CX3CR1	P49238	355 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RND2	P52198	227 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ATP1B3	P54709	279 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TCTA	P57738	103 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SMIM11A	P58511	58 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	HSD52	Q0P140	79 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RGN	Q15493	299 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ADIRF	Q15847	76 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	LEG1	Q6P5S2	330 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GKN2	Q86XP6	184 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR2T33	Q8NG76	320 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR4X1	Q8NH49	305 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	BLNK	Q8WV28	456 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PTX4	Q96A99	478 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	FGGY	Q96C11	551 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TSSK3	Q96PN8	268 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GABRG3	Q99928	467 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RSG1	Q9BU20	258 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TM2D1	Q9BX74	207 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057		Q9H3A6	140 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	C1orf198	Q9H425	327 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	BANF2	Q9H503	90 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		2.55	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	AK3	Q9UIJ7	227 aa		2.55	□□□□□ -2

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