RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-208ENST00000506437 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 BET1LQ9NYM9 111 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 OR5B21A6NL26 309 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 H7BYZ3 331 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 BCL3P20749 454 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 PP6455Q8WZ26 134 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 DYSFO75923 2080 aa9.53□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 FSTP19883 344 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 LCN15Q6UWW0 184 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 OR8G5Q8NG78 346 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 OR2V2Q96R30 315 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 IMMP2LQ96T52 175 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.52□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PLA2G2AP14555 144 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TSPOP30536 169 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CTRLP40313 264 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM42Q69YG0 159 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SOCS1O15524 211 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SERF1AO75920 110 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 LYPD6Q86Y78 171 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR5B12Q96R08 314 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PARLQ9H300 379 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CHODLQ9H9P2 273 aa9.52□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 A0A0A6YYD4 124 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 DIRC3C9JPN6 131 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR7C2O60412 319 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 GNMTQ14749 295 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MORN2Q502X0 79 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 NGBQ9NPG2 151 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SCAND1P57086 179 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MUC15Q8N387 334 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.51□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 UCP1P25874 307 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SLC25A17O43808 307 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CST7O76096 145 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 NXPH3O95157 252 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 IGHV1-46P01743 117 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 RAB9AP51151 201 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 FUT6P51993 359 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CCL17Q92583 94 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ACANP16112 2415 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 A0A0U1RQK1 487 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 HS3ST1O14792 307 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 IL3RAP26951 378 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ADMP35318 185 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 RHOGP84095 191 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 Q8N976 141 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms