RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 DISP2A7MBM2 1401 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GV50 99 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 EVPLLA8MZ36 301 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 TXNDC9O14530 226 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF728P0DKX0 622 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 GPR84Q9NQS5 396 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 AGLP35573 1532 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 RREB1Q92766 1687 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CCL1P22362 96 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 FXYD7P58549 80 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 AP1S1P61966 158 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 SS18Q15532 418 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 HIST3H3Q16695 136 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 RGS21Q2M5E4 152 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZS52 159 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 OR8J2Q8NGG1 315 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL16Q9H2A7 254 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CASZ1Q86V15 1759 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRB2O60241 1585 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 GLI3P10071 1580 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 SLX4Q8IY92 1834 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ALOX5APP20292 161 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 MAP2K4P45985 399 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CEBPGP53567 150 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CAV1Q03135 178 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB125Q8N687 156 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 TIAM1Q13009 1591 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP74Q9C0B2 1584 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1GO43497 2377 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ERICH3Q5RHP9 1530 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 BHLHE40O14503 412 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 FAM228BP0C875 321 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1C1Q04828 323 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 COQ4Q9Y3A0 265 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 FAM135AQ9P2D6 1515 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CUL9Q8IWT3 2517 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 OR5J2Q8NH18 312 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF675Q8TD23 568 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 PRELID1Q9Y255 219 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC12Q96J65 1359 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SETD5Q9C0A6 1442 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 ATP7AQ04656 1500 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 DISP1Q96F81 1524 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 REREQ9P2R6 1566 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TET3O43151 1660 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TNNC2P02585 160 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 P0DMU3 169 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 FAM231AP0DMU4 169 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 FAM231CP0DMU5 169 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF90Q03938 601 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 ROPN1LQ96C74 230 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 MPDZO75970 2070 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 OR5G3P0C626 314 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 RAP1GDS1P52306 607 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 OR2F1Q13607 317 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 MIAQ16674 131 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms