RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
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NISCH-213ENST00000489895 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.33□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.33□□□□□ -0.11
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NISCH-213ENST00000489895 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.33□□□□□ -0.12
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NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.33□□□□□ -0.12
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NISCH-213ENST00000489895 RNF151Q2KHN1 245 aa14.32□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 TMEM177Q53S58 311 aa14.32□□□□□ -0.12
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NISCH-213ENST00000489895 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
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NISCH-213ENST00000489895 CGB1A6NKQ9 187 aa14.32□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.32□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A28Q96A46 364 aa14.32□□□□□ -0.12
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.31□□□□□ -0.12
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NISCH-213ENST00000489895 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.31□□□□□ -0.12
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NISCH-213ENST00000489895 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.121e-11■■■■□ 20.4
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NISCH-213ENST00000489895 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.3□□□□□ -0.12
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NISCH-213ENST00000489895 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 A0A087X0M5 115 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GX30 115 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 MORN2Q502X0 79 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 SMUG1Q53HV7 270 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 NABP1Q96AH0 204 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 DIRC3C9JPN6 131 aa14.28□□□□□ -0.12
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