RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNA7	P36544	502 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	LPAR6	P43657	344 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TNXA	Q16473	311 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS8	Q16651	343 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JLM5	398 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD11	O94819	623 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RPA2	P15927	270 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB25	P57735	213 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01619	G3V211	115 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAPC5	O75971	98 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PI3	P19957	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424		H0Y980	276 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	S1PR2	O95136	353 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR132	Q9UNW8	380 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	OVOL1	O14753	267 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	KRAS	P01116	189 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CADM3	Q8N126	398 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF2	P09038	288 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA3	P12429	323 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DHODH	Q02127	395 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	BAK1	Q16611	211 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM140	Q9NV12	185 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TNC	P24821	2201 aa		13.33	□□□□□ -0.27
HDAC10-216	ENST00000489424	UPK2	O00526	184 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	IL7	P13232	177 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-G	P17693	338 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	G6PC	P35575	357 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CD69	Q07108	199 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF585B	Q52M93	769 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM209B	Q5JX69	171 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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