RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 HLA-GP17693 338 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 RAB25P57735 213 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 RND3P61587 244 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ZNF45Q02386 682 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 BAK1Q16611 211 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 OR11H1Q8NG94 326 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 BATF3Q9NR55 127 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 MCUBQ9NWR8 336 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 COA4Q9NYJ1 87 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 GPR132Q9UNW8 380 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 DBX1A6NMT0 343 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 S100GP29377 79 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 MAS1LP35410 378 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 OR2B8PP59922 312 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 DEFA6Q01524 100 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 OR4A5Q8NH83 315 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SEC22AQ96IW7 307 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TMEM68Q96MH6 324 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 A0A087WW49 117 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 H0Y980 276 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SLC6A1P30531 599 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SLURP1P55000 103 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ERVK-16P61578 105 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 RUNX1Q01196 453 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 FHL3Q13643 280 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TMEM230Q96A57 120 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SPIN2AQ99865 258 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 PRRT1Q99946 306 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SLC2A8Q9NY64 477 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 PRR13Q9NZ81 148 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 COPZ2Q9P299 210 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 A0A0G2JRQ6 117 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 H3BUA1 57 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 IGKV1-5P01602 117 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TRBV12-3P01733 135 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SERPINE2P07093 398 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 OR5AC1P0C628 307 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CD40LGP29965 261 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 S4R3C0 116 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 OR2J3O76001 311 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 BRI3O95415 125 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CRYGCP07315 174 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CTRB1P17538 263 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 UCP1P25874 307 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 PSMB6P28072 239 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 RHOGP84095 191 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ZNF616Q08AN1 781 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 DCUN1D4Q92564 292 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 HINT2Q9BX68 163 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 NAA60Q9H7X0 242 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.35□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms