RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNAP25P60880 206 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK10Q15131 360 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPINK9Q5DT21 86 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CENPWQ5EE01 88 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPINK6Q6UWN8 80 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 DHFR2Q86XF0 187 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q8N814 137 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC112Q8NEF3 446 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR8B3Q8NGG8 313 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERPINI1Q99574 410 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CIB1Q99828 191 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKHQ9HCJ1 492 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RMND1Q9NWS8 449 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5AC2Q9NZP5 309 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFNKQ9P0W0 207 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RP1P56715 2156 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED12Q93074 2177 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHD5Q8TDI0 1954 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 GREB1Q4ZG55 1949 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ESPL1Q14674 2120 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 IRGMA1A4Y4 181 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 K7EIL1 84 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0QYV0 167 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TXNDC9O14530 226 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKR7A2O43488 359 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SHBGP04278 402 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRYGCP07315 174 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT1GP13640 62 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRMP19623 302 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ORM2P19652 201 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TUBG1P23258 451 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10J1P30954 320 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCR2P41597 374 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2BQ00403 316 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOLPP1Q86YN1 238 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYS1Q8N2H4 156 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB123Q8N688 67 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR51L1Q8NGJ5 315 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACY3Q96HD9 319 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 YIPF3Q9GZM5 350 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TUBG2Q9NRH3 451 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 KPTNQ9Y664 436 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP160Q12769 1436 aa-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.6□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 FMN2Q9NZ56 1722 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPATQ14207 1427 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GTQ1 180 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MGAT4DA6NG13 374 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITGB1BP1O14713 200 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2L6O14933 153 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYTH3O43739 400 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK14O94921 469 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL28P46779 137 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 EFNA4P52798 201 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 FXYD7P58549 80 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACTBP60709 375 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB14P61106 215 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACTG1P63261 375 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 BTN3A2P78410 334 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNA12Q03113 381 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAM1Q15629 374 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00523Q86TU6 105 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR11H6Q8NGC7 330 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 LGALS14Q8TCE9 139 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PGLYRP3Q96LB9 341 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 DMAC2Q9NW81 257 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-0.6□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.61□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.61□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 USF3Q68DE3 2245 aa-0.61□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RIMS2Q9UQ26 1411 aa-0.61□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RREB1Q92766 1687 aa-0.61□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa-0.61□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GW54 56 aa-0.61□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa-0.61□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAPPC2LH3BP13 241 aa-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms