RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486199.5

PHF20L1-215, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 2

Gene PHF20L1, Length 1,633 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-215	ENST00000486199	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199		Q6ZS52	159 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	PIAS1	O75925	651 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	S100P	P25815	95 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	IMPA1	P29218	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	GABRA3	P34903	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	THBS3	P49746	956 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	MED29	Q9NX70	200 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	MRAS	O14807	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	PSG2	P11465	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	CCL1	P22362	96 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	CCR2	P41597	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	DIO3	P55073	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ARPP19	P56211	112 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	HERVK_113	P63121	156 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	VCX	Q9H320	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199		B4DEV8	164 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TPST1	O60507	370 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	DEDD	O75618	318 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	FBP1	P09467	338 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	CRISP2	P16562	243 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF83	P51522	516 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	EMP1	P54849	157 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ELOC	Q15369	112 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199		Q8N377	158 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR2T27	Q8NH04	317 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LYSMD1	Q96S90	227 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LXN	Q9BS40	222 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20L1-215	ENST00000486199	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.72
PHF20L1-215	ENST00000486199	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.33	□□□□□ -1.72
PHF20L1-215	ENST00000486199	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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