RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 OR10A2Q9H208 303 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF878C9JN71 531 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZG16O60844 167 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 GYPAP02724 150 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 HLA-DOBP13765 273 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ADIPOQQ15848 244 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 FAM78BQ5VT40 261 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 PARLQ9H300 379 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 LIME1Q9H400 295 aa6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PP11 408 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 PRSS37A4D1T9 235 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 F2Z2F3 143 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF737O75373 536 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 CST7O76096 145 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 HLA-HP01893 362 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 WNT2P09544 360 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF728P0DKX0 622 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 OR3A4PP47883 348 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 PPP1CBP62140 327 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 FAM27BQ5VT28 67 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 PECRQ9BY49 303 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SLC16A7O60669 478 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 TOX4O94842 621 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 TTRP02766 147 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ADH4P08319 380 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 CELA3BP08861 270 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 Q0VG73 95 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 EFNB3Q15768 340 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 OR5AS1Q8N127 324 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 RSG1Q9BU20 258 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 FLNCQ14315 2725 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNHIT1O43257 154 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SSSCA1O60232 199 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 GPX1P07203 203 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 OR10J4P0C629 311 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 GABRA2P47869 451 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 KRTDAPP60985 99 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.38□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GW15 77 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SHISA9B4DS77 424 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 MLNRO43193 412 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF205O95201 554 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 CRISP2P16562 243 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 NPBWR2P48146 333 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 UEVLDQ8IX04 471 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.37□□□□□ -1.39
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USP4-211ENST00000485450 VSIRQ9H7M9 311 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 FAM206AQ9NX38 181 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 JPT1Q9UK76 154 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 TMEM50AO95807 157 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 STAG3L2P0CL84 134 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 CTLA4P16410 223 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF154Q13106 437 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 DEFB125Q8N687 156 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SPACA5Q96QH8 159 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 RAB29O14966 203 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ZNF253O75346 499 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 IFNA5P01569 189 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 REG1AP05451 166 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 MSR1P21757 451 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ACKR1Q16570 336 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 COMMD2Q86X83 199 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SPIN2AQ99865 258 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.37□□□□□ -1.39
USP4-211ENST00000485450 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.37□□□□□ -1.39
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