RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 B9A039 149 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 DEDDO75618 318 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 CSN3P07498 182 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 PRRX1P54821 245 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 RAMP3O60896 148 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 HKR1P10072 659 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 CD24P25063 80 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 P2RY1P47900 373 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ATOH7Q8N100 152 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 CD177Q8N6Q3 437 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 RARRES2Q99969 163 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 GNB4Q9HAV0 340 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1B0GU03 582 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 CRISP2P16562 243 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 DLX1P56177 255 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 J3QR06 171 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF253O75346 499 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF737O75373 536 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 COX5AP20674 150 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 MMDQ15546 238 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 HCP5Q6MZN7 132 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 LIME1Q9H400 295 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC25A17O43808 307 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 DIRC2Q96SL1 478 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 BET1LQ9NYM9 111 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 A8MXK9 166 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 TRGC1P0CF51 173 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ADIPOQQ15848 244 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 MARVELD3Q96A59 401 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 NTNG2Q96CW9 530 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF222A6NCQ9 220 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 SRRM5B3KS81 715 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 IFNL4K9M1U5 179 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 REG1AP05451 166 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 UCP3P55916 312 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 PAX5Q02548 391 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF126Q9BV68 326 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 NAPSAO96009 420 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 HERPUD1Q15011 391 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 PNKDQ8N490 385 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 RBP4P02753 201 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 LCN2P80188 198 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 RBKSQ9H477 322 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM140Q9NV12 185 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 POLQO75417 2590 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 HPRT1P00492 218 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP5J2P56134 94 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF146Q15072 292 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 Q56UQ5 140 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 GALNT14Q96FL9 552 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 COQ2Q96H96 371 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 CHEK1O14757 476 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ORM2P19652 201 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 THBS3P49746 956 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6P435 159 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM56Q96MV1 263 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 HES4Q9HCC6 221 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms