RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471246.1

UBXN4-207, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN4, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-207ENST00000471246 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
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UBXN4-207ENST00000471246 AKR1C3P42330 323 aa0.05□□□□□ -2.4
UBXN4-207ENST00000471246 DNASE1L1P49184 302 aa0.05□□□□□ -2.4
UBXN4-207ENST00000471246 ACTG1P63261 375 aa0.05□□□□□ -2.4
UBXN4-207ENST00000471246 RBM3P98179 157 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
UBXN4-207ENST00000471246 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
UBXN4-207ENST00000471246 SYCP1Q15431 976 aa0.05□□□□□ -2.4
UBXN4-207ENST00000471246 TRAM1Q15629 374 aa0.05□□□□□ -2.4
UBXN4-207ENST00000471246 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
UBXN4-207ENST00000471246 SLC36A2Q495M3 483 aa0.05□□□□□ -2.4
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