RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468254.5

CEP170-211, Transcript of centrosomal protein 170, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CEP170, Length 2,972 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170-211ENST00000468254 LINC00310P59036 64 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 HLA-DRB3P79483 266 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 ZNF345Q14585 488 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 RSU1Q15404 277 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 IGFBP7Q16270 282 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 PDZD11Q5EBL8 140 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 AADACL3Q5VUY0 350 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 LYG2Q86SG7 212 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 MTURNQ8N3F0 131 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 C22orf15Q8WYQ4 148 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 SUCNR1Q9BXA5 334 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 NMES1Q9C002 83 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 FXYD6Q9H0Q3 95 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 C11orf1Q9H5F2 150 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 ZNF286AQ9HBT8 521 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa2.78□□□□□ -1.96
CEP170-211ENST00000468254 A0A1B0GU03 582 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 DPRXA6NFQ7 191 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 DEFB108AA8MXU0 73 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 INS-IGF2F8WCM5 200 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SOCS1O15524 211 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 YPEL1O60688 119 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 PFDN1O60925 122 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SFT2D2O95562 160 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 IL2RGP31785 369 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 MPV17P39210 176 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 GNG2P59768 71 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 BLOC1S1P78537 153 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 OR8G1Q15617 311 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 POU2AF1Q16633 256 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SMIM21Q3B7S5 101 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 Q6ZN92 141 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 Q6ZPA2 131 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ZNF788Q6ZQV5 615 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 YPEL2Q96QA6 119 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 TTTY10Q9BZA0 68 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 RERGLQ9H628 205 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 COA4Q9NYJ1 87 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 AK3Q9UIJ7 227 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SEC16AO15027 2179 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 BDP1A6H8Y1 2624 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 G3V3Q6 166 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 C15orf65H3BRN8 121 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 CDIPTO14735 213 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ATP6V0E1O15342 81 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 TSPAN15O95858 294 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 MT-ND4P03905 459 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 P0C879 139 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 VEGFCP49767 419 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 GPM6AP51674 278 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SMAGPQ0VAQ4 97 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 GUK1Q16774 197 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 TMEM128Q5BJH2 165 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 STPG2Q8N412 459 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 LY6G5BQ8NDX9 201 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 CASTOR1Q8WTX7 329 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 C18orf12Q96KH6 178 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 S100A13Q99584 98 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SULT4A1Q9BR01 284 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ARL6Q9H0F7 186 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 OR51J1Q9H342 316 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 MED9Q9NWA0 146 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 JPT1Q9UK76 154 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 CUL9Q8IWT3 2517 aa2.77□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SMKR1H3BMG3 65 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 K7N7A8 449 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ZG16O60844 167 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 LYZL6O75951 148 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 IFNA2P01563 188 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 IGHV1-46P01743 117 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 IGHV2-5P01817 119 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ARG1P05089 322 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SERPINA2P20848 420 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 KIR2DS2P43631 304 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 CACNG7P62955 275 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.76□□□□□ -1.97
CEP170-211ENST00000468254 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms