RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466274.1

NCL-208, Transcript of nucleolin, human

TSL 2

Gene NCL, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCL-208	ENST00000466274	CLINT1	Q14677	625 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	OXA1L	Q15070	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	PRSS8	Q16651	343 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GAPT	Q8N292	157 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	REEP1	Q9H902	201 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	THYN1	Q9P016	225 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	NDUFA4	O00483	81 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GABRP	O00591	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	CYB5B	O43169	146 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	RPA2	P15927	270 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	SERPINA2	P20848	420 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GPR183	P32249	361 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ASIP	P42127	132 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	MNAT1	P51948	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	EMP1	P54849	157 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	DEFB131A	P59861	70 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	UBE2K	P61086	200 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	PSME3	P61289	254 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	CDK5	Q00535	292 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GK3P	Q14409	553 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274		Q9H3A6	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	SC5D	O75845	299 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	CDRT1	O95170	752 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ZBTB25	P24278	435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	CCR9	P51686	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	IRF3	Q14653	427 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	RNF2	Q99496	336 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	FEV	Q99581	238 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	TBX5	Q99593	518 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274		S4R3C0	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274		A0A087WYN8	130 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274		M0R1X1	148 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NCL-208	ENST00000466274	CHEK1	O14757	476 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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