RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 HRASP01112 189 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 OR4A8P0C604 315 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 NPY1RP25929 384 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 AKAP13Q12802 2813 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 A0A1W2PPV4 95 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 TMPRSS2O15393 492 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 CT45A6P0DMU7 189 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 CT45A5P0DMU8 189 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 CT45A7P0DMV0 189 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 NPPCP23582 126 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 NDUFA6P56556 154 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 BSPH1Q075Z2 132 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 MIC13Q5XKP0 118 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PHOX2AO14813 284 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 MGAQ8IWI9 3026 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 IFITM10A6NMD0 228 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 MYOD1P15172 320 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 NDUFB7P17568 137 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 FOXC1Q12948 553 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ENY2Q9NPA8 101 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PRNDQ9UKY0 176 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PDE6DO43924 150 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 VENTXO95231 258 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 CA2P00918 260 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 STAG3L2P0CL84 134 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 STAG3L3P0CL85 134 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ATP5G3P48201 142 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 GFRALQ6UXV0 394 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 FRZBQ92765 325 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 CEP250Q9BV73 2442 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 IGKV1-16P04430 117 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 RTL8BQ17RB0 113 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 H7BYZ3 331 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 UPK2O00526 184 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 FCN3O75636 299 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 TRGC1P0CF51 173 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 UBE2G2P60604 165 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 GNB1P62873 340 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 TEPPQ6URK8 271 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 B2MP61769 119 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 PRCDQ00LT1 54 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 SSX8Q7RTT4 187 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 FNDC10F2Z333 226 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 CXorf1O96002 111 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 GALR1P47211 349 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 NEUROG1Q92886 237 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 NIT2Q9NQR4 276 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 F6UZH7 168 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM178BH3BS89 294 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 J3QR06 171 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 CST9LP1Q5W188 147 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 STPG3Q8N7X2 389 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 NECAP1Q8NC96 275 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF714Q96N38 554 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 BET1LQ9NYM9 111 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 PPIAL4DF5H284 164 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 CCL3L1P16619 93 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 OR5B12Q96R08 314 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 HINT2Q9BX68 163 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN9-201ENST00000445369 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms