RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 COPZ2Q9P299 210 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa13.07□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 E7EUB6 86 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 H0Y980 276 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 KRASP01116 189 aa13.07□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 PI3P19957 117 aa13.07□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 OR11H1Q8NG94 326 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 OR51S1Q8NGJ8 323 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 USMG5Q96IX5 58 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.07□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 FAUP35544 74 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB136Q30KP8 78 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 TOMM5Q8N4H5 51 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 GDPD1Q8N9F7 314 aa13.06□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 COMMD5Q9GZQ3 224 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 SRRQ9GZT4 340 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 COA4Q9NYJ1 87 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.06□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 KLK9Q2XQG4 91 aa13.05□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 SEC22AQ96IW7 307 aa13.05□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR5B12Q96R08 314 aa13.05□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 C5orf66Q9H5L9 145 aa13.05□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 KLK9Q9UKQ9 250 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 CGB1A6NKQ9 187 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 ATG12O94817 140 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 UCP1P25874 307 aa13.04□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1L8Q8NGR8 309 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 TP53RKQ96S44 253 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 PRNDQ9UKY0 176 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM223BA6NKX1 122 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 DHFRP00374 187 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 MYOD1P15172 320 aa13.03□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 CTRB2Q6GPI1 263 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00299Q6ZSB3 139 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-204ENST00000442563 NECAP1Q8NC96 275 aa13.03□□□□□ -0.32
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RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-11P01762 117 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAPPC2P0DI81 140 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAPPC2BP0DI82 140 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 AREGP15514 252 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF343Q6P1L6 599 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5B3Q8NH48 314 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 NAA60Q9H7X0 242 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGEF1-204ENST00000442563 OR51B2Q9Y5P1 312 aa13.02□□□□□ -0.33
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