RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 NRGNQ92686 78 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EN84 100 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R135 149 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4S2Q8NH73 311 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SPSB1Q96BD6 273 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF799Q96GE5 643 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 RARRES3Q9UL19 164 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 G3V4G9 280 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YJW9 148 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1-5P01602 117 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 MSR1P21757 451 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SRD5A2P31213 254 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 TCL1AP56279 114 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 U3KQA8 63 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PNR3 127 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLC1P0CG04 106 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 IGFBP7Q16270 282 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE10A6NGK3 116 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 BMPR1BO00238 502 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A6P12236 298 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 S100GP29377 79 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 SSTR5P35346 364 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOBP62745 196 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMAT4Q9H898 229 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 GP6Q9HCN6 339 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 RAMP3O60896 148 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 HSBP1O75506 76 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 REG1AP05451 166 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 NPY1RP25929 384 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 CFHR2P36980 270 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TNXAQ16473 311 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 MED12LQ86YW9 2145 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 hDV102S1A0JD36 115 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 LRP5LA4QPB2 252 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R2Z0 102 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 EFNA2O43921 213 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2G1P62253 170 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 GJC3Q8NFK1 279 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN14O95500 239 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR12P47775 334 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 HHEXQ03014 270 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 FXYD3Q14802 87 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 LMX1AQ8TE12 382 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087X0K7 114 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 MT-ND6P03923 174 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIAL4GP0DN37 164 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 EDDM3BP56851 147 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRA6Q16445 453 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF12Q5T6F0 453 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf54Q6X4T0 127 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf35Q96D05 121 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 ABI3Q9P2A4 366 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms