RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 SEC22AQ96IW7 307 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RNF5Q99942 180 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 GOSR2O14653 212 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 ADAP1O75689 374 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 IFNA21P01568 189 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 IGKV1-5P01602 117 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TMEM11P17152 192 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 LGALS7P47929 136 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-11P60412 298 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 FCN2Q15485 313 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 POU2AF1Q16633 256 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 FAM219AQ8IW50 185 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 CADM3Q8N126 398 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RHOVQ96L33 236 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
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PRAME-208ENST00000438888 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 CCSO14618 274 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 OR2F2O95006 317 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 IGLV2-23P01705 113 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 HLA-GP17693 338 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 HNF4GQ14541 408 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 NMSQ5H8A3 153 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 OR4A47Q6IF82 309 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SSX9Q7RTT3 188 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 Q8N6K4 173 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RITA1Q96K30 269 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TMEM140Q9NV12 185 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 A0A0G2JRQ6 117 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 C5orf51A6NDU8 294 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 HMX3A6NHT5 357 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 FAM25EA8MYX2 175 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 NBR2O15453 112 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SPDEFO95238 335 aa9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-208ENST00000438888 P0C879 139 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 CNTFRP26992 372 aa9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-208ENST00000438888 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-208ENST00000438888 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 GPR146Q96CH1 333 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SPIN2AQ99865 258 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 KIAA1456Q9P272 454 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TNCP24821 2201 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 MPTX1A8MV57 137 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 RRHO14718 337 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A17O43808 307 aa9.78□□□□□ -0.84
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PRAME-208ENST00000438888 OR2A4O95047 310 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 SIX6O95475 246 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 CXCL3P19876 107 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 F2RL1P55085 397 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 CD69Q07108 199 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 ZNF329Q86UD4 541 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TEX45Q8NA69 505 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 NPBQ8NG41 125 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 OR4A5Q8NH83 315 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 DPF1Q92782 380 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 OR2A7Q96R45 310 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 BET1LQ9NYM9 111 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 CACNG5Q9UF02 275 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-208ENST00000438888 TENM3Q9P273 2699 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GU03 582 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 PSMB11A5LHX3 300 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 NUDT19A8MXV4 375 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 UPK2O00526 184 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-208ENST00000438888 SNAPC5O75971 98 aa9.77□□□□□ -0.85
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