RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 SSTR5P35346 364 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 PRSS12P56730 875 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 LINC01545Q5VT33 79 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 AICDAQ9GZX7 198 aa6.01□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 R4GN57 208 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 MFAP2P55001 183 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF585BQ52M93 769 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF880Q6PDB4 577 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 KIR3DL3Q8N743 410 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GUT8 65 aa6□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 MOSP00540 346 aa6□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 FCER1GP30273 86 aa6□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ITLN1Q8WWA0 313 aa6□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 RAX2Q96IS3 184 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TBX15Q96SF7 602 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 MIEN1Q9BRT3 115 aa6□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 LOC105371242A0A075B767 164 aa6□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 NDUFS8O00217 210 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 CD55P08174 381 aa6□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 TMEM262E9PQX1 116 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 H3BRM9 83 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 NDUFB8O95169 186 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 IER3P46695 156 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 GNG10P50151 68 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 AESQ08117 197 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 SPATA46Q5T0L3 261 aa6□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 LPAL2Q16609 132 aa5.99□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 C17orf100A8MU93 164 aa5.99□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 TMEM11P17152 192 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.99□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 CCL17Q92583 94 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TP53RKQ96S44 253 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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ALMS1-201ENST00000423048 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 H3BUA1 57 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV3-1P01715 115 aa5.99□□□□□ -1.45
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