RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5□□□□□ -1.61
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USP40-202ENST00000409945 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USP40-202ENST00000409945 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.99□□□□□ -1.61
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USP40-202ENST00000409945 CD34P28906 385 aa4.97□□□□□ -1.61
USP40-202ENST00000409945 RAB7AP51149 207 aa4.97□□□□□ -1.61
USP40-202ENST00000409945 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
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USP40-202ENST00000409945 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.97□□□□□ -1.61
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