RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 NUP50Q9UKX7 468 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 OR51B2Q9Y5P1 312 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 OTOGQ6ZRI0 2925 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 A0A0D9SG52 128 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 CEBPZOSA8MTT3 80 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 OOSP1A8MZH6 123 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 RAB40CQ96S21 281 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 CLCC1Q96S66 551 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 PSENENQ9NZ42 101 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 TCF19Q9Y242 345 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 CST7O76096 145 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 MOSP00540 346 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 CRYGBP07316 175 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 ARHGDIBP52566 201 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 VMA21Q3ZAQ7 101 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 TMEM252Q8N6L7 170 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 HINT2Q9BX68 163 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 FBXL15Q9H469 300 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 SPCS3P61009 180 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 RPL8P62917 257 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 MMDQ15546 238 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 SPANXN5Q5MJ07 72 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 PRNDQ9UKY0 176 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 SIGLEC9Q9Y336 463 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 WSB1Q9Y6I7 421 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 FCN1O00602 326 aa16.1■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 TMEM217Q8N7C4 229 aa16.1■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 SMIM8Q96KF7 97 aa16.1■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 A0A1B0GW64 132 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 BCL2L11O43521 198 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 GPR137BO60478 399 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 MED6O75586 246 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 OR10W1Q8NGF6 305 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 OR52E5Q8NH55 327 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 VSTM2AQ8TAG5 236 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 C22orf15Q8WYQ4 148 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 OR4C12Q96R67 309 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 FBXL17Q9UF56 701 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 CGB1A6NKQ9 187 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 METTL15P1P0C7V9 234 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 THNSL2Q86YJ6 484 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 TEX45Q8NA69 505 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 OR2T10Q8NGZ9 312 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 WFDC1Q9HC57 220 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 CYTL1Q9NRR1 136 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-202ENST00000405333 J3QLI3 93 aa16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 SPDEFO95238 335 aa16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 PRSS8Q16651 343 aa16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 Q8N6K4 173 aa16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 RRHO14718 337 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 NBR2O15453 112 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 ARL16Q0P5N6 197 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 EBI3Q14213 229 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R27Q86WC6 154 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 OR4A5Q8NH83 315 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 COMMD5Q9GZQ3 224 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 TMEM11P17152 192 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 GNB1P62873 340 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 RNF5Q99942 180 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 GON7Q9BXV9 100 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 TAS2R30P59541 319 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 PRCDQ00LT1 54 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 CLINT1Q14677 625 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 PLGLAQ15195 96 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 NPBQ8NG41 125 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 PIFOQ8TCI5 191 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 TMEM170AQ8WVE7 144 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-202ENST00000405333 FAM96BQ9Y3D0 163 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.9 ms