RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC32Q9BV29 185 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CENPXA8MT69 81 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRASP01116 189 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PF4V1P10720 104 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UCP1P25874 307 aa11.94□□□□□ -0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAA60Q9H7X0 242 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PRX2 142 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUDT19A8MXV4 375 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOX15O60248 233 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNAPC5O75971 98 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL7P13232 177 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 G6PCP35575 357 aa11.93□□□□□ -0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.93□□□□□ -0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GALNT14Q96FL9 552 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC22AQ96IW7 307 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TP53RKQ96S44 253 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRNDQ9UKY0 176 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VSIG4Q9Y279 399 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR9G9P0C7N8 305 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RUNX1Q01196 453 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM16LQ309B1 348 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5B3Q8NH48 314 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLK15Q9H2R5 256 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0G2JLM5 398 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX22C9J3V5 150 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDS2O95674 445 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV1-39P01597 117 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PF4P02776 101 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV1D-39P04432 117 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2B8PP59922 312 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM219AQ8IW50 185 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL22RA2Q969J5 263 aa11.91□□□□□ -0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.91□□□□□ -0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRYGCP07315 174 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5AC1P0C628 307 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANXA3P12429 323 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRPXP78539 464 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SP6Q3SY56 376 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5T1Q8NG75 326 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.9□□□□□ -0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 USMG5Q96IX5 58 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM223BA6NKX1 122 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C15orf61A6NNL5 157 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRGV3P03979 118 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKR1C2P52895 323 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPPP2P59282 170 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF846Q147U1 533 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4A16Q8NH70 328 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM230Q96A57 120 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM56Q96MV1 263 aa11.89□□□□□ -0.51
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