RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM14Q96QK8 99 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 VWA8A3KMH1 1905 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LILRA5A6NI73 299 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC730098B7Z3J9 87 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BRM9 83 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM178BH3BS89 294 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PITX3O75364 302 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RTP5Q14D33 572 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TCF23Q7RTU1 214 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN19Q8N6F1 224 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF128Q8TEB7 428 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2L10Q9HD36 194 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MED31Q9Y3C7 131 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CD300LBA8K4G0 201 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF737O75373 536 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CRLF1O75462 422 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC2A10O95528 541 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DANCRP0C864 163 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 NMUP48645 174 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MDFICQ9P1T7 246 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPM6Q9BX84 2022 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZIC3O60481 467 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 THBDP07204 575 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GAGE2BQ13066 116 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ICAM4Q14773 271 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GAGE2EQ4V326 116 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GFI1Q99684 422 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RP1P56715 2156 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 HCFC1P51610 2035 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC13O75165 2243 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS38A1L453 326 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 KLRB1Q12918 225 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LRTM2Q8N967 370 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR31Q8NA23 367 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF563Q8TA94 476 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 EPOPA6NHQ4 379 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PRH1P02810 166 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35B1P78383 322 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXI1Q12951 378 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR3DS1Q14943 382 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM78AQ5JUQ0 283 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 STUMQ69YW2 141 aa5.64□□□□□ -1.51
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RABGEF1-202ENST00000380828 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PP55 124 aa5.64□□□□□ -1.51
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RABGEF1-202ENST00000380828 LMO2P25791 158 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ADIGQ0VDE8 80 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OTPQ5XKR4 325 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM219Q86XT9 240 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF695Q8IW36 515 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GATD1Q8NB37 220 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 FZR1Q9UM11 496 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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