RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 BRI3O95415 125 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 TRGV3P03979 118 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 OR9G9P0C7N8 305 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 G6PCP35575 357 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 MYCNOSP40205 109 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 CNPY1Q3B7I2 92 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF491Q8N8L2 437 aa12□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.99□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.98□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 S100ZQ8WXG8 99 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 TP53RKQ96S44 253 aa11.98□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.98□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 APELAP0DMC3 54 aa11.97□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 AKR1C2P52895 323 aa11.97□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 BAK1Q16611 211 aa11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.97□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 HMX3A6NHT5 357 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 CYB5BO43169 146 aa11.96□□□□□ -0.49
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANXA3P12429 323 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFA6Q01524 100 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 SP6Q3SY56 376 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 CASTOR1Q8WTX7 329 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 DPF1Q92782 380 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 RAX2Q96IS3 184 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51B2Q9Y5P1 312 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM223BA6NKX1 122 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX22C9J3V5 150 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 I3L521 148 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CDS2O95674 445 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1-39P01597 117 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1D-39P04432 117 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5AC1P0C628 307 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 IL7P13232 177 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 AKR1C4P17516 323 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMB6P28072 239 aa11.95□□□□□ -0.5
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PGGT1B-202ENST00000379615 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM219AQ8IW50 185 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 GALNT14Q96FL9 552 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM56Q96MV1 263 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5B12Q96R08 314 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 P2RX4Q99571 388 aa11.95□□□□□ -0.5
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