RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ZNRF1Q8ND25 227 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SGMS2Q8NHU3 365 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SFXN3Q9BWM7 321 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 LY96Q9Y6Y9 160 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 EFNB3Q15768 340 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 PRSS8Q16651 343 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 C3orf36Q3SXR2 165 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 TEX38Q6PEX7 206 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 FAM222BQ8WU58 562 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 PGPEP1LA6NFU8 196 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 CT45A1Q5HYN5 189 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 OR4A47Q6IF82 309 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 MOGAT3Q86VF5 341 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 STPG3Q8N7X2 389 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 CT45A3Q8NHU0 189 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SDSLQ96GA7 329 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 C9JCJ5 164 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 GATA4P43694 442 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 PRR20EP86478 221 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 PRR20CP86479 221 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 PRR20DP86480 221 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 PRR20BP86481 221 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 PRR20AP86496 221 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 BEND2Q8NDZ0 799 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 BDP1A6H8Y1 2624 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 MT-CO2P00403 227 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 GLRXP35754 106 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 RAB31Q13636 194 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SPRNQ5BIV9 151 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SEM1Q6ZVN7 128 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF439Q8NDP4 499 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 OR10G8Q8NGN5 311 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SSMEM1Q8WWF3 244 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFAF3Q9BU61 184 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 PRR14LQ5THK1 2151 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 AREGP15514 252 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 IQCJQ1A5X6 159 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 OCC1Q8TAD7 63 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 NEUROG1Q92886 237 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SSTP61278 116 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 TIMM23BQ5SRD1 257 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 UTF1Q5T230 341 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 CORO2AQ92828 525 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 C2orf88Q9BSF0 95 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00574Q9H8X3 128 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 ASCL3Q9NQ33 180 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV3-7P01780 117 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM30BQ3MIR4 351 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HOXD1-201ENST00000331462 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 CA2P00918 260 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF83P51522 516 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 SELENOTP62341 195 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 RPL31P62899 125 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 PIP4P1Q86T03 277 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 ENY2Q9NPA8 101 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 WT1P19544 449 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 ITLN1Q8WWA0 313 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 UHRF2Q96PU4 802 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 IL36BQ9NZH7 164 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 PRNDQ9UKY0 176 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 PCNX2A6NKB5 2137 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00869P0C866 280 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 RAB4BP61018 213 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 SSX2Q16385 188 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 STUMQ69YW2 141 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 TCF23Q7RTU1 214 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 LEAP2Q969E1 77 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 K7EN84 100 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 M0R1B8 84 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 SELLP14151 372 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 CEACAM4O75871 244 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 ADMP35318 185 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 PRCDQ00LT1 54 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD1-201ENST00000331462 RNF7Q9UBF6 113 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms