RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBPP20226 339 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECI1P42126 302 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPAR6P43657 344 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2B8PP59922 312 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPCAT3Q6P1A2 487 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSM6Q6P461 480 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF429Q86V71 674 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHFPL1Q86WI0 220 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SORL1Q92673 2214 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAP30O75446 220 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD74P04233 296 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYGCP07315 174 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF2P09038 288 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZP3P21754 424 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D26Q86UD7 250 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4D10Q8NGI6 311 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR25Q96S07 402 aa15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPPA5A6NC42 116 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2J3O76001 311 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA6P05013 189 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMB6P28072 239 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-16P61578 105 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 NECAP1Q8NC96 275 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 REG1AP05451 166 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTRB1P17538 263 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 S100GP29377 79 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 G6PCP35575 357 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R19P59542 299 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5G2Q06055 141 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL18Q14116 193 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK9Q2XQG4 91 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 C15orf32Q32M92 178 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTDSPLO15194 276 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRASP01116 189 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP5CP53041 499 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CADM3Q8N126 398 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 BMPR1BO00238 502 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB3DO95716 219 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGAM2P15259 253 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 PI3P19957 117 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RND3P61587 244 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFB8O95169 186 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1-39P01597 117 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1D-39P04432 117 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNJ2BPP57105 145 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCFD2Q8NI22 146 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4C12Q96R67 309 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSG2Q9Y328 171 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHFRP00374 187 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPNP16150 400 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGPP57054 158 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPEL1Q2QD12 228 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC22AQ96IW7 307 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC140Q96MF4 163 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms