RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 MPV17P39210 176 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR12P47775 334 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMB3P49720 205 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 MEOX2P50222 304 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 PDLIM4P50479 330 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB7AP51149 207 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 EFNA4P52798 201 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 CEBPGP53567 150 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF585BQ52M93 769 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 SSX8Q7RTT4 187 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR86Q86TI4 376 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1L1Q8NH94 360 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB39BQ96DA2 213 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 BTF3L4Q96K17 158 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 C12orf57Q99622 126 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 RARRES2Q99969 163 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 VAX2Q9UIW0 290 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 JPT1Q9UK76 154 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 TANC2Q9HCD6 1990 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GWJ7 208 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5H1A6NKK0 313 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YL77 283 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BP45 60 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2CO00762 179 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGB1BP1O14713 200 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 CYB5BO43169 146 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 MLNRO43193 412 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 YPEL1O60688 119 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 MPDU1O75352 247 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 NXPH3O95157 252 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 HPRT1P00492 218 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYAAP02489 173 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDX2P32119 198 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 GLIPR1P48060 266 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 FABP6P51161 128 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVS71-1P61550 626 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB11AP62491 216 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL20P78556 96 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 DLK1P80370 383 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 RUNX1Q01196 453 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 COL10A1Q03692 680 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 AESQ08117 197 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR82Q6UXN9 313 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4A16Q8NH70 328 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 DTD1Q8TEA8 209 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC29Q8WV35 223 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 LHX4Q969G2 390 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 YPEL2Q96QA6 119 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4C12Q96R67 309 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 GPHA2Q96T91 129 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF251Q9BRH9 671 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 GGACTQ9BVM4 153 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 RPRMQ9NS64 109 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 GNG13Q9P2W3 67 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPE2 198 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ODAMA1E959 279 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SMCO3A2RU48 225 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf52A6NGY3 159 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 VSTM5A8MXK1 200 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SRRM5B3KS81 715 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM250H0YL14 139 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN34H7C241 214 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF737O75373 536 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 KRASP01116 189 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV2-14P01704 120 aa5.77□□□□□ -1.49
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