RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 GAMTQ14353 236 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PDPNQ86YL7 162 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 GUCD1Q96NT3 240 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 NABP2Q9BQ15 211 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SPRY4Q9C004 299 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 EML5Q05BV3 1969 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 MLNRO43193 412 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 AMY1AP04745 511 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IER3P46695 156 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TMEM186Q96B77 213 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CYYR1Q96J86 154 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SOD3P08294 240 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 BRS3P32247 399 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ATP5G3P48201 142 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 VWC2Q2TAL6 325 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TREML4Q6UXN2 200 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 UPK2O00526 184 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR10J4P0C629 311 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 KRTDAPP60985 99 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CD177Q8N6Q3 437 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PAXXQ9BUH6 204 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C15orf62A8K5M9 175 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 GFRALQ6UXV0 394 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TIMD4Q96H15 378 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C9JCJ5 164 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CORTO00230 105 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 APCSP02743 223 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RTP5Q14D33 572 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.35□□□□□ -1.23
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HERC3-201ENST00000264345 DEFA4P12838 97 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CHEK1O14757 476 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TYMSP04818 313 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PRCDQ00LT1 54 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RELBQ01201 579 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PAX5Q02548 391 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PYY3Q5JQD4 70 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 MMD2Q8IY49 270 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 LINC00473A8K010 186 aa7.34□□□□□ -1.23
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HERC3-201ENST00000264345 GNB1P62873 340 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SCGB2A2Q13296 93 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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HERC3-201ENST00000264345 SLC31A2O15432 143 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ZNF253O75346 499 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R60P59551 318 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 LINC01551Q86U37 167 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TBX15Q96SF7 602 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 BET1LQ9NYM9 111 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 HSBP1O75506 76 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CNIH1O95406 144 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IGHV2-70P01814 119 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 AREGP15514 252 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 LGALS7P47929 136 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 MISP3Q96FF7 219 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 KNTC1P50748 2209 aa7.34□□□□□ -1.24
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