RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ASCL2Q99929 193 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 NUDT3O95989 172 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 CRYGSP22914 178 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ISOC2Q96AB3 205 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 NPFFO15130 113 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ATP5J2P56134 94 aa7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PPE3 182 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ITGB1BP1O14713 200 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 GDF9O60383 454 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.61□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PP11 408 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TIAF1O95411 115 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-13P01766 116 aa7.61□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 LEMD1Q68G75 181 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 PRO1933Q9H354 126 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 H3BRM9 83 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF525Q8N782 197 aa7.61□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 TBR1Q16650 682 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM101Q96IK0 257 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PRD5 423 aa7.61□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PRF3 423 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PRM7 423 aa7.61□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 NBR2O15453 112 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 CRYBA2P53672 197 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 WBP1Q96G27 269 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 CBY3A6NI87 242 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 OSTCQ9NRP0 149 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 FGF16O43320 207 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 PRCDQ00LT1 54 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 UQCRFS1P47985 274 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 DTX1Q86Y01 620 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 M0R1W7 72 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF137PP52743 207 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 HCP5Q6MZN7 132 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 FAM168AQ92567 244 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 NPIPB3Q92617 1050 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 RARRES2Q99969 163 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf172C9J069 976 aa7.59□□□□□ -1.19
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