RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 MAS1LP35410 378 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 ODAMA1E959 279 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 CECR9P0C854 216 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 FAM157CP0CG43 387 aa9.28□□□□□ -0.92
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URB2-201ENST00000258243 C7orf71A4D174 169 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 A8MWL6 223 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 H3BUT2 72 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 FSTP19883 344 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 SAXO1Q8IYX7 474 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 OR9G1Q8NH87 305 aa9.28□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 NPIPB13A6NJU9 1138 aa9.27□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 NPIPB4C9JG80 1138 aa9.27□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 H0Y980 276 aa9.27□□□□□ -0.92
URB2-201ENST00000258243 CRYBA2P53672 197 aa9.27□□□□□ -0.92
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URB2-201ENST00000258243 HTN1P15515 57 aa9.27□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 KLK2P20151 261 aa9.27□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 GPR132Q9UNW8 380 aa9.27□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 MPDU1O75352 247 aa9.27□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 LCN2P80188 198 aa9.27□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 OR4X1Q8NH49 305 aa9.27□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.27□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 JMJD8Q96S16 334 aa9.27□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 ISG15P05161 165 aa9.27□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 RUNX1Q01196 453 aa9.27□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.27□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 CXorf1O96002 111 aa9.26□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.26□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 MMD2Q8IY49 270 aa9.26□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 AMELYQ99218 206 aa9.26□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.26□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.26□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.26□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 TMEM189A5PLL7 270 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 CDKN1AP38936 164 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 P2RY4P51582 365 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 PSG5Q15238 335 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 LHX2P50458 406 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 PAX2Q02962 417 aa9.25□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 DPRXA6NFQ7 191 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 C17orf51A8MQB3 221 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 ESDP10768 282 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 TNFRSF9Q07011 255 aa9.25□□□□□ -0.93
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URB2-201ENST00000258243 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 J3KRW8 73 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 PTGDSP41222 190 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 TMEM50BP56557 158 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 ATP5G2Q06055 141 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 TMEM186Q96B77 213 aa9.25□□□□□ -0.93
URB2-201ENST00000258243 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.25□□□□□ -0.93
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