RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TTC9CQ8N5M4 171 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 DMBX1Q8NFW5 382 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 SEC22AQ96IW7 307 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 PHB2Q99623 299 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 HRASLSQ9HDD0 168 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 PF4P02776 101 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 FGF2P09038 288 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 FHL3Q13643 280 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 BAK1Q16611 211 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 SAMD5Q5TGI4 173 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 OR5B12Q96R08 314 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 SPIN2AQ99865 258 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 PRRT1Q99946 306 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 SLA2Q9H6Q3 261 aa17.26■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 G3V4G9 280 aa17.25■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 H0Y980 276 aa17.25■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 OR9G9P0C7N8 305 aa17.25■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 ECI1P42126 302 aa17.25■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 OR2B8PP59922 312 aa17.25■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.25■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa17.24■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 TRGV3P03979 118 aa17.24■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 TPPP2P59282 170 aa17.24■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 ZNF45Q02386 682 aa17.24■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 OXLD1Q5BKU9 147 aa17.24■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 GDPD1Q8N9F7 314 aa17.24■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 OR11H1Q8NG94 326 aa17.24■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 COPZ2Q9P299 210 aa17.24■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 DBX1A6NMT0 343 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 AREGP15514 252 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-16P61578 105 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 CNPY1Q3B7I2 92 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 SP6Q3SY56 376 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 C19orf35Q6ZS72 473 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 TMEM230Q96A57 120 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 MCUBQ9NWR8 336 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 COA4Q9NYJ1 87 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 NSG2Q9Y328 171 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 DNAH3Q8TD57 4116 aa17.23■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-11P01762 117 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 PRH1P02810 166 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 CRYGCP07315 174 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 P0C879 139 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 IGLL1P15814 213 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 CD33P20138 364 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 CD40LGP29965 261 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 DEFA5Q01523 94 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 KLK9Q2XQG4 91 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 C1QL4Q86Z23 238 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 KLK9Q9UKQ9 250 aa17.22■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 IGLC7A0M8Q6 106 aa17.21■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB5A8MRT5 1133 aa17.21■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-5P01602 117 aa17.21■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 SERPINE2P07093 398 aa17.21■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 UCP1P25874 307 aa17.21■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa17.21■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 OR1N2Q8NGR9 330 aa17.21■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 GLYATL2Q8WU03 294 aa17.21■□□□□ 0.35
SYF2-201ENST00000236273 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 CTRB1P17538 263 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 AP3S2P59780 193 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 BEAN1Q3B7T3 259 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 CTRB2Q6GPI1 263 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 DEDD2Q8WXF8 326 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 FANCD2OSQ96PS1 177 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 NAA60Q9H7X0 242 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 OR5AC1P0C628 307 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 PSMB6P28072 239 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 OR10W1Q8NGF6 305 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 LHFPL5Q8TAF8 219 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 COMMD5Q9GZQ3 224 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 AKIP1Q9NQ31 210 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TMEM14BQ9NUH8 114 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa17.2■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WW49 117 aa17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 CDS2O95674 445 aa17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 FAUP35544 74 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 ZNF616Q08AN1 781 aa17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A42Q86VD7 318 aa17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TMEM222Q9H0R3 208 aa17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 OR51B2Q9Y5P1 312 aa17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 DMRT1Q9Y5R6 373 aa17.19■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JLM5 398 aa17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms