RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 J3QRE1 110 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 IGLV1-44P01699 117 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CD55P08174 381 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SYT8Q8NBV8 401 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PRX2 142 aa6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TIMM23O14925 209 aa6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 MEOX2P50222 304 aa6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZP1P60852 638 aa6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TMEM42Q69YG0 159 aa6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 NIT2Q9NQR4 276 aa6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.65□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 PDE6DO43924 150 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 C1QL1O75973 258 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 REG4Q9BYZ8 158 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ACACBO00763 2458 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 HTN1P15515 57 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 PRTN3P24158 256 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TMEM187Q14656 261 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF79Q15937 498 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 REG1AP05451 166 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 PCP4P48539 62 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 COTL1Q14019 142 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 UQCC3Q6UW78 93 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 SDK2Q58EX2 2172 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.64□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 DEDDO75618 318 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF124Q15973 351 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 GAB2Q9UQC2 676 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.64□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 OR2T8A6NH00 312 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 GUK1Q16774 197 aa6.63□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.63□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 H3BUX3 64 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 UPK2O00526 184 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 MPZP25189 248 aa6.63□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.63□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 OR9G9P0C7N8 305 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 HKR1P10072 659 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 UBE2E1P51965 193 aa6.63□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 CR1LQ2VPA4 569 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.63□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 P01737 135 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 CD5P06127 495 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 SEC11BP0C7V7 166 aa6.63□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 CD177Q8N6Q3 437 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 MSGN1A6NI15 193 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 OR2C1O95371 312 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TDGF1P3P51864 188 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 NDUFA6P56556 154 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 EFNB1P98172 346 aa6.63□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF345Q14585 488 aa6.63□□□□□ -1.35
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