RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 HMX3A6NHT5 357 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 LALBAP00709 142 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CD36P16671 472 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CELP19835 753 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ARFRP1Q13795 201 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 OR4S2Q8NH73 311 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 PHYHIPQ92561 330 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CENPOQ9BU64 300 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.32□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 LINC00473A8K010 186 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 DEFB4AO15263 64 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 TGOLN2O43493 480 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ATP8B1O43520 1251 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 FCGR3BO75015 233 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CLEC3BP05452 202 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CD1AP06126 327 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CRYGCP07315 174 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF735P0CB33 412 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 PSMD7P51665 324 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 KLK9Q2XQG4 91 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CBR4Q8N4T8 237 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 APH1BQ8WW43 257 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 C5orf30Q96GV9 206 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 OR2A7Q96R45 310 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 OR51E2Q9H255 320 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 KCNK15Q9H427 330 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.31□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 A0A0A6YYD4 124 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 NDUFA4O00483 81 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 MYL12BO14950 172 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 SOCS1O15524 211 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CIB2O75838 187 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CDK1P06493 297 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CD3GP09693 182 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 MIFP14174 115 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 AREGP15514 252 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 HLA-DMBP28068 263 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 RANBP1P43487 201 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 RASSF2P50749 326 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 IRF3Q14653 427 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 Q6ZTC4 211 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 Q8NAQ8 132 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CMTM3Q96MX0 182 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.3□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 C15orf61A6NNL5 157 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 C16orf90A8MZG2 172 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 M0R2N4 97 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 SLC22A5O76082 557 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 REG1AP05451 166 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 FCGR3AP08637 254 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 CRHBPP24387 322 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 QRFPP83859 136 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 P2RY14Q15391 338 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 IGSF11Q5DX21 431 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM80Q96HE8 168 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 ATP6V0BQ99437 205 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 PECRQ9BY49 303 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.29□□□□□ -1.4
HLA-B-257ENST00000640094 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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