RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00303	Q3SY05	128 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP69	Q49AA0	526 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX30	Q5JUR7	227 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP82	Q8N141	532 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	YIPF5	Q969M3	257 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM106A	Q96A25	262 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	JPT2	Q9H910	190 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	COPZ2	Q9P299	210 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ALG5	Q9Y673	324 aa		3.77	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RELN	P78509	3460 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GABARAP	H6UMI1	98 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R036	132 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	MAS1	P04201	325 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	HPN	P05981	417 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CD2	P06729	351 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5H8	P0DN80	308 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR3DL2	P43630	455 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GNG10	P50151	68 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35A1	P78382	337 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ARG2	P78540	354 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXF1	Q12946	379 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GAPT	Q8N292	157 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8NBF4	154 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PIFO	Q8TCI5	191 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	AMELY	Q99218	206 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	MED28	Q9H204	178 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PROK2	Q9HC23	129 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DIABLO	Q9NR28	239 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CKLF	Q9UBR5	152 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA1B	Q00975	2339 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GJE1	A6NN92	205 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNGR1	O43759	233 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TCRB	P04435	133 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf88	P0DMB2	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	MYCNOS	P40205	109 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFA5	Q16718	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OTP	Q5XKR4	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SPINK14	Q6IE38	97 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	STPG2	Q8N412	459 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CHST4	Q8NCG5	386 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2M3	Q8NG83	312 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	EMC6	Q9BV81	110 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	MED29	Q9NX70	200 aa		3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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