RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	OR5T1	Q8NG75	326 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SVIL	O95425	2214 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	DIRC3	C9JPN6	131 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	TUSC2	O75896	110 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DS4	P43632	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DS1	Q14954	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	COX19	Q49B96	90 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	GAPT	Q8N292	157 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF709	Q8N972	641 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	DEGS1	O15121	323 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SERF1A	O75920	110 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF205	O95201	554 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	TNFSF4	P23510	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	CDKN1A	P38936	164 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	UCN	P55089	124 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	FBLN7	Q53RD9	439 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	LYG1	Q8N1E2	194 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659		Q8NFD4	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	IFNL4	K9M1U5	179 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	HYPM	O75409	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	F2R	P25116	425 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	TESK1	Q15569	626 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	PIGY	Q3MUY2	71 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	BAGE3	Q86Y29	109 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	BAGE2	Q86Y30	109 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SFRP2	Q96HF1	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	OR5B21	A6NL26	309 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF253	O75346	499 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINE2	P07093	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM11	P17152	192 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	MKX	Q8IYA7	352 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	GPR146	Q96CH1	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf94	C9JXX5	98 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659		H3BP45	60 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	PRRG2	O14669	202 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV1-44	P01699	117 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	MT-ND6	P03923	174 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	RAC2	P15153	192 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	KITLG	P21583	273 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	CA6	P23280	308 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	GNG3	P63215	75 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	RAX	Q9Y2V3	346 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	MGA	Q8IWI9	3026 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	CECR9	P0C854	216 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	BCL3	P20749	454 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00310	P59036	64 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	PMCHL1	Q16048	86 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	OR4C12	Q96R67	309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GUS0	222 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	DLL1	O00548	723 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	GPX1	P07203	203 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	DYRK2	Q92630	601 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM12	Q96EX1	92 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	VPS25	Q9BRG1	176 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BBS1-225	ENST00000630659	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		12.76	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms