RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 SARAFQ96BY9 339 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM140Q9NV12 185 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PROCRQ9UNN8 238 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PPQ1 181 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB124Q8NES8 71 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SVILO95425 2214 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MGST3O14880 152 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MYOD1P15172 320 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CFHR2P36980 270 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM249Q2WGJ8 235 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MIC13Q5XKP0 118 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 RHOVQ96L33 236 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SMCO3A2RU48 225 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 C1QTNF9P0C862 333 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CHRNA7P36544 502 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TMPRSS3P57727 454 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ALKBH2Q6NS38 261 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 C22orf34Q6ZV56 151 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OR5T1Q8NG75 326 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OR1P1Q8NH06 330 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OR52E5Q8NH55 327 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 S100PBPQ96BU1 408 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM204Q9BSN7 226 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CALYQ9NYX4 217 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 WASF3Q9UPY6 502 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MGAQ8IWI9 3026 aa11□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 VENTXO95231 258 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 IFNA10P01566 189 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OPRK1P41145 380 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CT45A1Q5HYN5 189 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OR4A16Q8NH70 328 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CT45A3Q8NHU0 189 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TMPRSS2O15393 492 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFB4O95168 129 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TYMSP04818 313 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TCF19Q9Y242 345 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 FAM215AQ9Y5M1 114 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 DNLZQ5SXM8 178 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM144Q7Z5S9 345 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ITLN1Q8WWA0 313 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PFDN5Q99471 154 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 AHRRA9YTQ3 701 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 M0R1B8 84 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 LY86O95711 162 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PDLIM4P50479 330 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB109BQ30KR1 87 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OR5B12Q96R08 314 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 FUT9Q9Y231 359 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 XKRY2A2RUG3 117 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 C15orf61A6NNL5 157 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PPP5D1E7EU14 171 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 STAG3L2P0CL84 134 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 STAG3L3P0CL85 134 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 IL3RAP26951 378 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 NUBP1P53384 320 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 KCNIP2Q9NS61 270 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SPRY3O43610 288 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OR2T10Q8NGZ9 312 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CACNA1HO95180 2353 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SCO2A0A1W2PP80 73 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PDE6DO43924 150 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CEACAM4O75871 244 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 GZMBP10144 247 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PAX1P15863 534 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CST9LP1Q5W188 147 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 VHLLQ6RSH7 139 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF439Q8NDP4 499 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SDSLQ96GA7 329 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 C14orf144Q96I85 54 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 S1PR3Q99500 378 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms