RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 IGKV1D-39P04432 117 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SERPINE2P07093 398 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 FBP1P09467 338 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SPP1P10451 314 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 COX7A1P24310 79 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SAA4P35542 130 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 LPAR6P43657 344 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 Q6YL49 198 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 A0A0G2JRQ6 117 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 A0A0U1RQK1 487 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 IGSF23A1L1A6 192 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 HSPA12AO43301 675 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 FBXO24O75426 580 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 MED6O75586 246 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM50AO95807 157 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ARG1P05089 322 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 OMGP23515 440 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 CAV2P51636 162 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 PAX9P55771 341 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 NHLH2Q02577 135 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 BAXQ07812 192 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF585BQ52M93 769 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 PRR18Q8N4B5 295 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM86BQ8N661 226 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 DRAM1Q8N682 238 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 OR51H1Q8NH63 302 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 OR1L1Q8NH94 360 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF596Q8TC21 504 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 GALMQ96C23 342 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 GPR146Q96CH1 333 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ESM1Q9NQ30 184 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 RNF212BA8MTL3 300 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 C15orf65H3BRN8 121 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 TOR1AO14656 332 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SPINT2O43291 252 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SSSCA1O60232 199 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 HBZP02008 142 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 APOC3P02656 99 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 OR8U9P0C7N5 309 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 NFYBP25208 207 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SSTR5P35346 364 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 RAB5CP51148 216 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 PRRX1P54821 245 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 F2RL1P55085 397 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 VAMP2P63027 116 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 OR8U1Q8NH10 309 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 RFESDQ8TAC1 157 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 MALSU1Q96EH3 234 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 F2RL2O00254 374 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 CHST1O43916 411 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ATG12O94817 140 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 IGKV1-5P01602 117 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 HTD2P86397 168 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 RELBQ01201 579 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 BTN1A1Q13410 526 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF266Q14584 549 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 Q3ZCU0 254 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 Q6ZRM9 215 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 OR9G1Q8NH87 305 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 UBALD1Q8TB05 177 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 C5orf30Q96GV9 206 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 AJUBAQ96IF1 538 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 RAB40CQ96S21 281 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-217ENST00000611848 HRH4Q9H3N8 390 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms