RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	TUBA4B	Q9H853	241 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	FAM223B	A6NKX1	122 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	BMPR1B	O00238	502 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	NAT1	P18440	290 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	ARL6IP1	Q15041	203 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	ABHD1	Q96SE0	405 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	PEMT	Q9UBM1	199 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MUC1-222	ENST00000610468	APELA	P0DMC3	54 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RHOG	P84095	191 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF45	Q02386	682 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	PHB2	Q99623	299 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00473	A8K010	186 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	CRYZL1	O95825	349 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TNXA	Q16473	311 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	NECAP1	Q8NC96	275 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RETN	Q9HD89	108 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TUSC2	O75896	110 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TPPP	O94811	219 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	CD81	P60033	236 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	CDK10	Q15131	360 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	FAM209B	Q5JX69	171 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	IL17D	Q8TAD2	202 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	SPIN2A	Q99865	258 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	MPPED1	O15442	326 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	PRH1	P02810	166 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	GNG2	P59768	71 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ATP5G2	Q06055	141 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	AP3S1	Q92572	193 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TNC	P24821	2201 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	JTB	O76095	146 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	CD7	P09564	240 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	C15orf32	Q32M92	178 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	MZT2A	Q6P582	158 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	MMD2	Q8IY49	270 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TEX22	C9J3V5	150 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	LGALS9	O00182	355 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ACTL6B	O94805	426 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	FOLR2	P14207	255 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TNFSF8	P32971	234 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	TALDO1	P37837	337 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MUC1-222	ENST00000610468	KLK9	Q2XQG4	91 aa		10.47	□□□□□ -0.73

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